省流:上新品,有促銷,含UMI的單細胞RNA-Seq分析試劑盒! | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
前言 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
什么是單細胞轉錄組測序? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
單細胞轉錄組測序,簡單來講,就是在單個細胞水平上,對轉錄組等遺傳信息進行高通量測序分析的一項技術。與常規高通量測序相比,能夠在更精細的單個細胞水平上獲得遺產信息,從而揭示每個細胞的基因表達狀態。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
單細胞mRNA-seq的挑戰是什么? | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
研究罕見或珍貴的樣本,比如神經元細胞、干細胞、CTC等,需要非常高的靈敏度和再現性,因為單個細胞中RNA的含量十分有限(根據單個細胞的大小等情況不同,每個細胞可能只含有幾十皮克的RNA)。因此,生成沒有偏倚的mRNA-seq cDNA文庫是很具有挑戰性的一項工作。 創新研究不斷推動新技術的邊界,以獲得引人注目的結果,而這其中仍然需要試劑、技術的支撐。在單細胞RNA-seq領域,Takara Bio提供的SMART技術,可以幫助研究人員進一步突破RNA-seq靈敏度上限,提供高質量的單細胞轉錄組分析結果。本次升級的產品SMART-Seq mRNA LP (with UMIs),是整合UMI的單細胞/微量樣本的mRNA全長分析建庫試劑盒。 |
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產品亮點 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· “高端”的技術萬里挑一 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
基于Takara Bio的核心SMART技術(Switching Mechanism at 5' End of RNA Template)優化改良,提供全長轉錄本信息,可以高靈敏度在單細胞水平上分析差異表達、融合基因、可變剪接等。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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· 加持的“標簽”鼎力相助 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
通過逆轉錄步驟添加分子標簽(UMIs),可以靈敏地識別PCR重復片段,并校正PCR擴增錯誤,從而獲得更高準確性的基因或轉錄本檢測數。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· 連貫的文庫構建流程 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
同時整合了Takara Bio專利性 的文庫構建技術(U.S. Patents 7,803,550, 8,399,199, 8,728,737, 9,598,727, 10,196,686, 10,208,337, 和11,072,823),利用特別的莖環形接頭構建高品質Illumina文庫!另外,搭配使用Unique Dual Index Kits(單獨銷售),可以提供完整的從樣品到cDNA合成到文庫構建的實驗體驗。同時搭配特別開發的Cogent NGS生物信息學分析軟件,能直接對下機數據進行分析! | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
性能展示 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· 再現性測試數據 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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以10 pg K562 RNA以及3種不同起始量 (100 pg, 1 ng和10 ng)的 UHR RNA樣本起始,使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)構建測序文庫,均做3個重復。然后進行測序,并使用CogentAP進行分析。結果顯示,重復之間相關性系數非常高。即使起始量為10 pg時,也具有非常高的重現性! | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· 靈敏度測試數據 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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對36例核酸含量較低的PBMC樣本,使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)制備文庫,并進行測序分析。結果顯示,通過基因表達譜分析確認了70%的PBMC是T細胞,這符合來自正常健康供體的PBMC預期比例。此外,還鑒定確認一個B細胞、一個NK細胞,一個單核細胞和兩個樹突狀細胞,另有6個細胞無法明確類型。由此也說明SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在單細胞水平的RNA-Seq分析上具有高靈敏度。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· 添加UMI校正偏差 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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分別對10 pg RNA和單個細胞獲得的RNA樣本,摻入ERCC control RNA后進行文庫制備,然后進行測序分析。結果顯示,添加UMI后,決定系數R2值明顯提高,表明添加UMI降低PCR duplication,獲得更準確的RNA counts。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· 兼容自動化平臺 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)兼容多種自動化液體工作站進行微縮化建庫。比如使用SMART-Seq mRNA LP (with UMIs)在Mantis Liquid Handler (Formulatrix)上將反應體系體積微縮至1/2(HV),1/4(QV)以及在mosquito HV liquid handler (SPT Labs)上將反應體系體積微縮至1/8,均能獲得與使用原反應體系高度一致的結果。保證性能的同時,降低了成本和操作時間! | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PS:另外還有兩款新品,也值得關注哦! | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· SMART-Seq® mRNA LP:少量細胞/微量樣本的mRNA-Seq文庫構建試劑盒。它使用oligo(dT)引物起始,優化用于從10 pg-100 ng的高品質total RNA(RIN≥8)或1-1000個完整細胞起始,生成高質量的測序文庫。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
· SMART-Seq® mRNA :少量細胞/微量樣本的cDNA合成試劑盒。它可以用于Ultra low RNA(10 pg-100 ng)或少量細胞(1-1000個完整細胞)cDNA合成的試劑盒,提供全長轉錄本的信息。 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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新品嘗鮮活動 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
看完心動的您,剛好可以參加一下新品首發直降福利哦! · 活動時間:2022年11月29日-2022年12月23日 · 活動品目及價格: |
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注:活動期間,每位客戶僅限一次訂單有效。 |